انسان‌ها همان‌گونه كه در رنگ پوست و مو و ديگر ويژگي‌هاي جسماني متفاوتند، در رنگ چشم نيز با هم فرق دارند. قسمت رنگي چشم عنبيه نام دارد كه دورتادور مردمك را فرا گرفته است. كار عنبيه درواقع عبور دادن نور از چشم و رسيدن آن به شبكيه چشم است. علت وجود رنگ كدر و تيره عنبيه وجود ملانين است. عنبيه با رنگدانه‌هاي ملانين پوشيده شده است كه البته درجات اين رنگدانه‌ها در چشم هر فرد با ديگري متفاوت است.
ملانين از حدود 10000 سال پيش مسوول رنگ‌ قهوه‌اي تيره در چشم بوده و اين رنگ‌ از قديمي‌ترين رنگ‌هاي چشم انسان‌ها بوده و هم اكنون هم افراد زيادي دردنيا رنگ چشمشان قهوه‌اي تيره است. اما به مرورزمان رنگدانه‌هاي موجود درجلوي عنبيه دچار جهش و تغيير شد و اين امر سبب شد تا نور از زير سلول‌هاي استروما عبور كند، وقتي اين نور به ما منعكس مي‌شود اين انعكاس به رنگ آبي است، لذا رنگ عنبيه آبي به نظر مي‌آيد. ديگر رنگ‌هاي چشم مانند سبز و خاكستري هم به دليل بازتاب‌هاي مختلف نور از سطح عنبيه است و امروزه درواقع جهش‌هاي ژني و فعل و انفعالات موجود در چشم و بخصوص عنبيه سبب بروز رنگ‌هاي گوناگون در چشم شده است.